Protein–RNA interactions for Protein: O15270

SPTLC2, Serine palmitoyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2O15270 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SPTLC2O15270 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPTLC2O15270 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SPTLC2O15270 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms