Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA5O15230 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA5O15230 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA5O15230 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms