Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
IRF6O14896 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IRF6O14896 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
IRF6O14896 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IRF6O14896 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IRF6O14896 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IRF6O14896 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IRF6O14896 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IRF6O14896 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
IRF6O14896 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IRF6O14896 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IRF6O14896 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IRF6O14896 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IRF6O14896 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IRF6O14896 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
IRF6O14896 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
IRF6O14896 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRF6O14896 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRF6O14896 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRF6O14896 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRF6O14896 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IRF6O14896 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IRF6O14896 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IRF6O14896 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRF6O14896 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRF6O14896 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRF6O14896 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRF6O14896 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRF6O14896 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRF6O14896 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRF6O14896 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRF6O14896 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRF6O14896 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRF6O14896 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
IRF6O14896 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRF6O14896 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IRF6O14896 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IRF6O14896 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IRF6O14896 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IRF6O14896 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRF6O14896 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
IRF6O14896 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRF6O14896 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
IRF6O14896 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRF6O14896 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRF6O14896 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRF6O14896 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRF6O14896 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRF6O14896 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRF6O14896 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRF6O14896 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRF6O14896 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRF6O14896 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRF6O14896 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRF6O14896 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRF6O14896 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRF6O14896 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRF6O14896 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRF6O14896 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRF6O14896 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRF6O14896 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRF6O14896 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRF6O14896 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRF6O14896 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IRF6O14896 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IRF6O14896 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IRF6O14896 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IRF6O14896 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
IRF6O14896 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IRF6O14896 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRF6O14896 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRF6O14896 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRF6O14896 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRF6O14896 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRF6O14896 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRF6O14896 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
IRF6O14896 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
IRF6O14896 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRF6O14896 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
IRF6O14896 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
IRF6O14896 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
IRF6O14896 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IRF6O14896 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IRF6O14896 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IRF6O14896 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IRF6O14896 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IRF6O14896 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IRF6O14896 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
IRF6O14896 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IRF6O14896 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
IRF6O14896 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
IRF6O14896 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
IRF6O14896 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IRF6O14896 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IRF6O14896 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IRF6O14896 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IRF6O14896 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IRF6O14896 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRF6O14896 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRF6O14896 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms