Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F3O00716 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F3O00716 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F3O00716 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F3O00716 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F3O00716 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F3O00716 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F3O00716 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F3O00716 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F3O00716 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F3O00716 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F3O00716 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F3O00716 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F3O00716 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F3O00716 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F3O00716 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F3O00716 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F3O00716 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F3O00716 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F3O00716 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
E2F3O00716 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F3O00716 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F3O00716 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F3O00716 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F3O00716 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F3O00716 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F3O00716 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F3O00716 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F3O00716 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F3O00716 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F3O00716 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F3O00716 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F3O00716 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F3O00716 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F3O00716 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F3O00716 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F3O00716 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F3O00716 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F3O00716 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F3O00716 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F3O00716 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F3O00716 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F3O00716 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F3O00716 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F3O00716 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F3O00716 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F3O00716 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F3O00716 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F3O00716 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F3O00716 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F3O00716 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F3O00716 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F3O00716 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F3O00716 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F3O00716 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F3O00716 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F3O00716 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F3O00716 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F3O00716 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F3O00716 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E2F3O00716 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
E2F3O00716 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
E2F3O00716 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E2F3O00716 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E2F3O00716 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E2F3O00716 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F3O00716 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F3O00716 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F3O00716 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F3O00716 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F3O00716 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F3O00716 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F3O00716 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F3O00716 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F3O00716 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F3O00716 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F3O00716 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F3O00716 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F3O00716 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F3O00716 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F3O00716 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F3O00716 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F3O00716 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F3O00716 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F3O00716 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F3O00716 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F3O00716 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F3O00716 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F3O00716 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F3O00716 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F3O00716 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F3O00716 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F3O00716 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F3O00716 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F3O00716 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F3O00716 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
E2F3O00716 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F3O00716 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F3O00716 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F3O00716 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms