Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EBAG9O00559 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EBAG9O00559 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms