Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX2-CTNND1H3BSU7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX2-CTNND1H3BSU7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms