Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L12C9JPN9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L12C9JPN9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L12C9JPN9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L12C9JPN9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
USP17L12C9JPN9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L12C9JPN9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L12C9JPN9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP17L12C9JPN9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
USP17L12C9JPN9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP17L12C9JPN9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L12C9JPN9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L12C9JPN9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L12C9JPN9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L12C9JPN9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L12C9JPN9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L12C9JPN9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L12C9JPN9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L12C9JPN9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L12C9JPN9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L12C9JPN9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L12C9JPN9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L12C9JPN9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L12C9JPN9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L12C9JPN9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L12C9JPN9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L12C9JPN9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L12C9JPN9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms