Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IDSB3KWA1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IDSB3KWA1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IDSB3KWA1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDSB3KWA1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDSB3KWA1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDSB3KWA1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDSB3KWA1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDSB3KWA1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IDSB3KWA1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
IDSB3KWA1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IDSB3KWA1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IDSB3KWA1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IDSB3KWA1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IDSB3KWA1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IDSB3KWA1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IDSB3KWA1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDSB3KWA1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDSB3KWA1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDSB3KWA1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IDSB3KWA1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IDSB3KWA1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDSB3KWA1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDSB3KWA1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IDSB3KWA1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IDSB3KWA1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IDSB3KWA1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IDSB3KWA1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IDSB3KWA1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms