Protein–RNA interactions for Protein: A6NM11

LRRC37A2, Leucine-rich repeat-containing protein 37A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC37A2A6NM11 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms