Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM200CA6NKL6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM200CA6NKL6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms