Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCNX2A6NKB5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCNX2A6NKB5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNX2A6NKB5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms