Protein–RNA interactions for Protein: A6NHY6

C9orf118, Putative uncharacterized protein C9orf118, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf118A6NHY6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf118A6NHY6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf118A6NHY6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms