Protein–RNA interactions for Protein: A6NFX1

MFSD2B, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2BA6NFX1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD2BA6NFX1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD2BA6NFX1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD2BA6NFX1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD2BA6NFX1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD2BA6NFX1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MFSD2BA6NFX1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MFSD2BA6NFX1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms