Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms