Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PABPN1LA6NDY0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.9 ms