Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNOT1A5YKK6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNOT1A5YKK6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT1A5YKK6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms