Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC13A5PLN9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC13A5PLN9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAPPC13A5PLN9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC13A5PLN9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC13A5PLN9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC13A5PLN9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC13A5PLN9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC13A5PLN9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC13A5PLN9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC13A5PLN9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC13A5PLN9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC13A5PLN9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC13A5PLN9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC13A5PLN9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC13A5PLN9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC13A5PLN9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC13A5PLN9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms