Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
CCDC144AA2RUR9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC144AA2RUR9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC144AA2RUR9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC144AA2RUR9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC144AA2RUR9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC144AA2RUR9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC144AA2RUR9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC144AA2RUR9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC144AA2RUR9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC144AA2RUR9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC144AA2RUR9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC144AA2RUR9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC144AA2RUR9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC144AA2RUR9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC144AA2RUR9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CCDC144AA2RUR9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CCDC144AA2RUR9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CCDC144AA2RUR9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms