Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf170A2RU37 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf170A2RU37 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf170A2RU37 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf170A2RU37 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf170A2RU37 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf170A2RU37 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf170A2RU37 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf170A2RU37 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf170A2RU37 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf170A2RU37 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf170A2RU37 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf170A2RU37 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf170A2RU37 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf170A2RU37 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf170A2RU37 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf170A2RU37 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms