Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLRN2A0PK11 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLRN2A0PK11 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLRN2A0PK11 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CLRN2A0PK11 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CLRN2A0PK11 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLRN2A0PK11 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms