Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms