Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms