Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms