Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms