Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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