Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms