Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR88Q6ZMY6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms