Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms