Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms