Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KRTAP21-2Q3LI59 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms