Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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