Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IKBKEQ14164 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IKBKEQ14164 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms