Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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COL9A2Q14055 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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COL9A2Q14055 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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COL9A2Q14055 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
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COL9A2Q14055 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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COL9A2Q14055 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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COL9A2Q14055 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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