Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms