Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms