Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPCQ01831 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPCQ01831 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPCQ01831 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPCQ01831 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPCQ01831 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPCQ01831 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPCQ01831 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPCQ01831 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPCQ01831 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPCQ01831 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPCQ01831 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
XPCQ01831 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPCQ01831 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPCQ01831 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPCQ01831 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPCQ01831 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPCQ01831 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
XPCQ01831 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPCQ01831 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPCQ01831 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPCQ01831 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPCQ01831 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPCQ01831 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPCQ01831 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
XPCQ01831 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPCQ01831 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPCQ01831 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPCQ01831 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPCQ01831 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPCQ01831 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPCQ01831 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPCQ01831 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPCQ01831 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPCQ01831 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPCQ01831 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPCQ01831 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPCQ01831 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPCQ01831 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPCQ01831 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPCQ01831 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPCQ01831 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPCQ01831 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPCQ01831 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPCQ01831 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPCQ01831 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPCQ01831 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPCQ01831 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPCQ01831 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPCQ01831 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPCQ01831 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPCQ01831 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPCQ01831 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms