Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZEB1P37275 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms