Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms