Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGCP20142 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGCP20142 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms