Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF3P18847 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF3P18847 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF3P18847 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF3P18847 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF3P18847 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF3P18847 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF3P18847 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF3P18847 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF3P18847 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF3P18847 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF3P18847 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF3P18847 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF3P18847 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF3P18847 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF3P18847 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF3P18847 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF3P18847 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF3P18847 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF3P18847 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF3P18847 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF3P18847 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF3P18847 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF3P18847 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF3P18847 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF3P18847 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF3P18847 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF3P18847 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF3P18847 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF3P18847 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF3P18847 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF3P18847 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF3P18847 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF3P18847 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF3P18847 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF3P18847 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF3P18847 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF3P18847 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF3P18847 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF3P18847 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF3P18847 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF3P18847 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF3P18847 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF3P18847 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF3P18847 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF3P18847 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF3P18847 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF3P18847 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF3P18847 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF3P18847 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF3P18847 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF3P18847 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF3P18847 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF3P18847 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF3P18847 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF3P18847 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF3P18847 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms