Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 TRMT13-201ENST00000370139 711 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms