Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms