Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms