Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms