Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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COMMD9Q9P000 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD9Q9P000 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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