Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms