Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms