Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM52Q96A61 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms