Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP1Q8N474 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP1Q8N474 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFRP1Q8N474 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFRP1Q8N474 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFRP1Q8N474 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFRP1Q8N474 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFRP1Q8N474 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFRP1Q8N474 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFRP1Q8N474 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFRP1Q8N474 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms