Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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TCF23Q7RTU1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TCF23Q7RTU1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TCF23Q7RTU1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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